ПЦР-праймеры и зонды для оценки экспрессии генов изоформ фосфолипазы С в клетках трансгенных растений картофеля с антисмысловой конструкцией для гена фосфолипазы С
https://doi.org/10.47612/0134-9740-2022-30-46-54
Аннотация
Разработаны ПЦР-праймеры, а также «TaqMan»-наборы для оценки экспрессии генов изоформ фосфолипазы C (ФлС) картофеля дикого типа (WT) и трансгенных растений, экспрессирующих антисмысловую РНК для ингибирования генов ФлС. Показано, что использование «TaqMan»-наборов для генов изоформ ФлС1 и ФлС3, а также гена-нормализатора ef1a в дуплексной ПЦР в реальном времени позволяет определять дифференциальную экспрессию соответствующих изоформ в различных тканях растений картофеля. Методом ПЦР с детекцией в «конечной точке» показано уменьшение экспресcии генов изоформ ФлС в клетках трансгенных растений по сравнению с WT-картофелем.
Об авторах
Т. А. Гапеева
ГНУ«Институт биофизики и клеточной инженерии Национальной академии наук Беларуси»
Беларусь
Беларусь
г. Минск
А. Н. Пундик
ООО «ГлобалГен»
Беларусь
Беларусь
г. Минск
Т. В. Семанюк
РУП «Научно-практический центр Национальной академии наук Беларуси по картофелеводству и плодоовощеводству»
Россия
Россия
аг. Самохваловичи, Минский район
Список литературы
1. Plant lipids: Key players of plasma membrane organization and function / A. Mamode Cassim [et al.] // Prog. Lipid Res. – 2019. – Vol. 73. – P. 1–27.
2. Boss, W. Lipid-mediated signaling / W. Boss, D. Lynch, X. Wang // Annual Plant Reviews. – 2008. – Vol. 33. – P. 202–43.
3. Specific membrane lipid composition is important for plasmodesmata function in Arabidopsis / M. S. Grison [et al.] // Plant Cell. – 2015. – Vol. 27, № 4. – P. 1228–1250.
4. Meijer, H. J. Phospholipid-based signaling in plants / H. J. Meijer, T. Munnik // Annu. Rev. Plant Biol. – 2003. – Vol. 54. – P. 265–306.
5. Wang, X. Plant phospholipases / X. Wang // Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. – 2001. – Vol. 52. – P. 211–231.
6. Plant phospholipase C family: Regulation and functional role in lipid signaling / A. Singh [et al.] // Cell Calcium. – 2015. – Vol. 58. – P. 139–146.
7. Zhang, B. Genome-wide identification and characterization of phospholipase C gene family in cotton (Gossypium spp.) / B. Zhang, Y. Wang, J. Y. Liu // Sci. China Life Sci . – 2018. – Vol. 61. – P. 88–99.
8. Biochemical characterization of the tomato phosphatidylinositol-specific phospholipase C (PI-PLC) family and its role in plant immunity / A. M. Abd-El-Haliem [et al.] // Biochim. Biophys. Acta. – 2016. – Vol. 1861. – P. 1365–1378.
9. Arabidopsis AtPLC2 is a primary phosphoinositide-specific phospholipase C in phosphoinositide metabolism and the endoplasmic reticulum stress response / K. Kanehara [et al.] // PLoS Gene. – 2015. – Vol. 11. – P. e1005511.
10. Arabidopsis phosphoinositide-specific phospholipase C 4 negatively regulates seedling salt tolerance / K. Xia [et al.] // Plant Cell Environ. – 2017. – Vol. 40. – P. 1317–1331.
11. Involvement of Phospholipase C in Photosynthesis and Growth of Maize Seedlings / Y. Wei [et al.] // Genes (Basel). – 2022. – Vol. 13, № 6 . – P. 1011.
12. Molecular and enzymatic characterization of three phosphoinositide-specific phospholipase C isoforms from potato / J. Kopka [et al.] // Plant Physiol. – 1998. – Vol. 116. – P. 239– 250.
13. A novel phosphatidylcholine-hydrolyzing phospholipase C induced by phosphate starvation in Arabidopsis / Y. J. Nakamura [et al.] // Biol. Chem. –2005. – Vol. 280. – P. 7469–7476.
14. Expression and evolution of the phosphoinositide-specific phospholipase C gene family in Arabidopsis thaliana / I. M. Tasma [et al.] // Plant Physiol. Biochem. PPB. – 2008. – Vol. 46. – P. 627–637.
15. Identification of tomato phosphatidylinositol-specific phospholipase-C (PI-PLC) family members and the role of PLC4 and PLC6 in HR and disease resistance / J. H. Vossen [et al.] // Plant J. – 2010. – Vol. 62. – P. 224–239.
16. Comprehensive genomic analysis and expression profiling of phospholipase C gene family during abiotic stresses and development in rice / A. Singh [et al.] // PLoS One. – 2013 . – Vol. 8, № 4 – P. e62494.
17. Genome-Wide Analysis and Expression Profiling of the Phospholipase C Gene Family in Soybean (Glycine max) / F. Wang [et al.] // PLoS One. – 2015. – Vol. 10, № 9 – P. e0138467.
18. Создание растений картофеля с генами для ингибирования синтеза фосфолипазы С / А. Н. Пундик [ и др.] // Картофелеводство : сб. науч. тр. / Науч.-практ. центр Нац. акад. наук Беларуси по картофелеводству и плодоовощеводству. – Минск, 2012. – Т. 20. – С. 85–94.
19. Sambrook J. W. Molecular cloning: A Laboratory manual / J. W. Sambrook // N.Y: Cold Spring Harb. Lab.Press. – 1989.
20. Livak, K. J. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method / K. J. Livak, T. D. Schmittgen // Methods . – 2001. – Vol. 4 – P. 402–408.
Рецензия
Для цитирования:
Гапеева Т.А., Пундик А.Н., Семанюк Т.В. ПЦР-праймеры и зонды для оценки экспрессии генов изоформ фосфолипазы С в клетках трансгенных растений картофеля с антисмысловой конструкцией для гена фосфолипазы С. Картофелеводство. 2022;30(1):46-54. https://doi.org/10.47612/0134-9740-2022-30-46-54
For citation:
Gapeeva T.A., Pundik A.N., Semanyuk T.V. PCR primers and probes for evaluating the expression of phospholipase C isoform genes in transgenic cells of potato plants with antisense construction for phospholipase C gene. Potato Growing. 2022;30(1):46-54. (In Russ.) https://doi.org/10.47612/0134-9740-2022-30-46-54
Просмотров: 89
Послать статью по эл. почте 